Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Hdac7Q8C2B3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Hdac7Q8C2B3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Hdac7Q8C2B3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Hdac7Q8C2B3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Hdac7Q8C2B3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac7Q8C2B3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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