Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms