Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp1Q8BJQ2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp1Q8BJQ2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp1Q8BJQ2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp1Q8BJQ2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp1Q8BJQ2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp1Q8BJQ2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp1Q8BJQ2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp1Q8BJQ2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp1Q8BJQ2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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