Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2eQ80UW8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms