Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Eci3Q78JN3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms