Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms