Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Timd4Q6U7R4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Timd4Q6U7R4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Timd4Q6U7R4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Timd4Q6U7R4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Timd4Q6U7R4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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