Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

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Length 821 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn3Q64691 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Capn3Q64691 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Capn3Q64691 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Capn3Q64691 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Capn3Q64691 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Capn3Q64691 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Capn3Q64691 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Capn3Q64691 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Capn3Q64691 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn3Q64691 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms