Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga3Q62470 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms