Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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SnrpaQ62189 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SnrpaQ62189 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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SnrpaQ62189 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SnrpaQ62189 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SnrpaQ62189 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SnrpaQ62189 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SnrpaQ62189 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SnrpaQ62189 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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