Protein–RNA interactions for Protein: Q61268

Apoc4, Apolipoprotein C-IV, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc4Q61268 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms