Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

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Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Slc5a6Q5U4D8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Slc5a6Q5U4D8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Slc5a6Q5U4D8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc5a6Q5U4D8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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