Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE31

Uncharacterized protein KIAA0930 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UE31 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3UE31 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3UE31 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3UE31 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3UE31 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3UE31 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3UE31 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3UE31 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3UE31 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3UE31 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3UE31 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3UE31 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3UE31 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3UE31 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3UE31 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3UE31 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3UE31 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3UE31 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3UE31 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3UE31 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3UE31 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3UE31 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3UE31 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3UE31 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3UE31 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3UE31 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3UE31 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3UE31 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3UE31 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3UE31 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms