Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc9Q3U0M1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms