Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf3c3Q3TMP1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf3c3Q3TMP1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms