Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TAF1AQ15573 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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