Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMD6Q15008 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms