Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms