Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CkbQ04447 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CkbQ04447 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms