Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs2Q03350 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms