Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfiaQ02780 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfiaQ02780 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms