Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Gjb2Q00977 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjb2Q00977 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms