Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza3P70190 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza3P70190 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms