Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vamp3P63024 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms