Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LmnaP48678 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms