Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnnal1O88327 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms