Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp4O70480 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms