Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TsksO54887 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TsksO54887 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TsksO54887 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TsksO54887 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TsksO54887 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TsksO54887 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TsksO54887 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TsksO54887 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsksO54887 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsksO54887 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsksO54887 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsksO54887 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsksO54887 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsksO54887 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsksO54887 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TsksO54887 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TsksO54887 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsksO54887 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsksO54887 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsksO54887 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TsksO54887 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsksO54887 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsksO54887 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsksO54887 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsksO54887 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TsksO54887 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TsksO54887 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms