Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRPF3O43395 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRPF3O43395 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms