Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pik3cdO35904 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms