Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Top6blJ3QMY9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Top6blJ3QMY9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Top6blJ3QMY9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Top6blJ3QMY9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Top6blJ3QMY9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Top6blJ3QMY9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Top6blJ3QMY9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Top6blJ3QMY9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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