Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gm21818J3KMS6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21818J3KMS6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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