Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arfip1G5E8V9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arfip1G5E8V9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms