Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms