Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap58B2RW38 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms