Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpb1B2RS76 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms