Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf518bB2RRE4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf518bB2RRE4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms