Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stxbp4Q9WV89 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stxbp4Q9WV89 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms