Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod1Q9R0E2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod1Q9R0E2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms