Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc2lQ9JME7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms