Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms