Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pus3Q9JI38 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms