Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn10Q9ESK3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn10Q9ESK3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms