Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rapgef4Q9EQZ6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rapgef4Q9EQZ6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms