Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab11fip1Q9D620 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rab11fip1Q9D620 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11fip1Q9D620 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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