Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms