Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc105Q9D4K7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms