Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl1Q99N96 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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