Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms