Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ApobrQ8VBT6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms